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L'apport de l'informatique distribuée dans
la recherche clinique

Gaëlle LAYANI

28 août 2000

Le projet SETI@Home fait des émules dans le secteur de la recherche clinique. Toutefois, cette fois, il ne s'agit pas de débusquer un éventuel signal extra-terrestre, mais d'étudier les effets secondaires de la chimiothérapie.

Le projet "Compute Against Cancer", lancé en mai dernier par la société Parabon et le National Cancer Institute, a pour objectif d'analyser les données recueillies par l'Université de Virginie en utilisant l'énergie et la puissance de traitement inexploitées des ordinateurs connectés à Internet. Le NCI espère ainsi modéliser la réaction de certains gènes à différents traitements anticancéreux, ce qui requiert une puissance de traitement et de calcul très importante.

L'idée n'est pas nouvelle, car les supercalculateurs, à même d'effectuer ce type de calculs, sont particulièrement onéreux. Le principe du "distributed computing" constitue donc une alternative intéressante.

Concrètement, la plate-forme de Parabon, baptisée Frontier, divise les données à analyser en tâches qu'il sous-traite à des ordinateurs connectés au réseau Internet. Le logiciel exécute les tâches lorsque l'ordinateur est en veille. Dès que l'ordinateur est réutilisé, le traitement de la tâche est interrompue et les résultats envoyés à Frontier. Celui-ci les réexpédie alors au client.

Les propriétaires de ces ordinateurs doivent d'abord télécharger le logiciel Pioneer à partir du site de la société Parabon pour pouvoir participer au projet. Ce logiciel a été conçu pour se faire aussi discret que possible. Le Dr Armentrout, fondateur de Parabon résume ainsi le fonctionnement de Pioneer : "Le logiciel fonctionne comme un économiseur d'écran. Quand il détecte que le système n'est pas utilisé, il lance alors le traitement de la première tâche qu'il trouve sur notre serveur. Dès que vous touchez votre souris ou utilisez votre clavier, le logiciel disparaît."

Le logiciel Pioneer est téléchargeable sur
le site de Parabon

Suite et fin (2/2)

28 août 2000

La solution MEDCOST pour vos essais cliniques

Lire aussi

L'interview de Mark Weitner, de Parabon.

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